费氏几十年行医生涯积累了丰富的临征经验，平素治学颇多心得，乃着手著书立说。他认为医学发展至今芜杂已极，必须执简驭繁救弊纠偏，以使后学者一归醇正。为此，他投入一生精力孜孜不倦地摸索，一切从临诊实际出发，博采古今学术之精华，不参杂门户偏见，努力探求立论平允不偏的醇正医学。笔耕数载终于完成《医醇》书稿（共24卷），并付刊刻，不料此书文稿连同藏扳一并毁于咸丰年间一场战火。此时，费氏避太平天国战乱于古延陵之寓斋（在苏北泰兴县五圩里），复患脚疾步履艰难，终日坐卧室中，值此闲遐时日，潜心著述，追忆往昔著作内容，随笔录出。撰成《医醇剩义》4卷。书成于同治二年（1863年），刻印之后盛行于世。嗣后又撰《医方论》4卷（1865年）。
综观费氏医学思想，以“醇正”、“缓和”为特色。其学术源于历代各家学术，由搏返约，取各家之长补偏救弊。《清史稿》有传，评曰：“清末江南诸医，以伯雄最著。”其子孙继承家学，以医名世。孟氏费氏作为著名医学世家和学术流派蜚声进代医坛。
